饲料配方是进行配合饲料的基础，饲料配方本身如有问题会直接影响畜牧业生产，有时会给养殖业带来不可挽回的损失，饲料配方设计存在的问题有：
应用的饲养标准不灵活
在设计饲料配方时，设计者都要参照一部饲养标准来设计。饲养标准推荐的需要量是动物在适宜的环境条件下，健康的动物对各种养分的最低要求，如果在配方设计时，把饲养标准看成是一成不变的，没有根据饲养实际动物的生长环境条件的变化及饲料在生产、贮存过程中的营养物质损失，特别是维生素的损失等情况作适当的调整，结果使动物不能满足其营养需要，很难充分发挥其生产性能。
配方设计不合理
设计的饲料配方中营养物质缺乏或营养物质不平衡，致使不能满足动物的生产需要，造成生产效率低；持续时间长，还可能导致动物某些营养物质缺乏，抵抗疾病的能力下降。
⑴能量蛋白比例不适宜：饲料中能量与蛋白的比例关系一般用能量蛋白比表示。在饲料配方设计时，首先应满足的是能量需要，而且要求能量和蛋白质的比例适宜。动物%26#8220;为能而食%26#8221;，当能量满足时，动物就会停止采食。如果能量蛋白比过高时，会造成蛋白质的摄入量不足，而能量蛋白比过低时，则蛋白质的摄入量会超过自身的需要，造成蛋白质的浪费。
⑵钙磷比例不平衡：为了降低饲料成本而大量使用廉价的石粉或含钙的物质作载体和稀释剂，导致钙磷比不平衡，影响了钙磷和其他矿物质的吸收。
⑶必须氨基酸不平衡：配方只注意了蛋白质的量，而忽视了必须氨基酸的供给，如猪饲料中缺乏赖氨酸；鸡饲料中缺乏氮氨酸，这些氨基酸的缺乏限制了动物对饲料中其他氨基酸的利用，使饲料中的蛋白质利用率降低。
原料选用不合理
原料选择不当，往往给畜牧业生产带来一系列隐患性灾难，片面追求饲料成本降低的结果，可造成养殖总成本的大幅上升，甚至是毁灭性疫病的爆发。
⑴蛋白质源选用不合理：过多地使用棉籽粕和菜籽粕，结果造成动物消化不良或中毒等症状。
⑵选用的饲料体积过大：如过多地使用麦麸类饲料，使饲料的能量浓度降低，造成消化道的负担过重。在猪、鸡的饲料配方中粗纤维的含量过高，影响了猪、鸡对其他营养物质的消化。
⑶饲料的适口性差：有的饲料营养价值虽高，但适口性差，如血粉和菜籽粕，如饲料配方设计时不加以考虑则直接影响饲料的适口性和采食量。
⑷饲料种类单一：饲料单一可造成营养不全面，多种饲料的营养成分有互补作用，从而可提高饲料的利用率，并使整个日粮的营养价值提高。如饲料单一会降低动物的适口性和采食量。
饲料配方成本高
配合饲料的设计必须具有合理的经济效益，一般要求饲料成本不超过动物生产总成本的70%为宜。如饲料成本过高，则获得利润将会降低，同样是不可取的。
来源：中国农产品加工网
